Phase 2 是為配合毀滅戰士2的模組而做的。Freedoom 的一大吸引力，在於它能替代原版毀滅戰士，用來執行玩家們製作的成千上萬個關卡；凡是為毀滅戰士2或 Final Doom 設計的內容，就該選 Phase 2 這一半。
戰役由一連串關卡組成，每一關都有一條通往出口的路線，怪物會拼命阻攔。挑戰一部分來自探索和尋找隱藏的東西，一部分來自緊張的戰鬥，你要決定每一槍往哪兒打、什麼時候開火。主線之外還有隱藏關卡 MAP31 和 MAP32，留給找得到入口的玩家。
30 多年來，毀滅戰士的模組社群在原版遊戲的基礎上做出了大量關卡、模組，甚至完整的新遊戲。Freedoom 專案希望每個人都能享受這些作品，也希望社群保持自由和獨立，因此提供了一個任何人都能遊玩、分享、修改和再利用的替代品。
| 按鍵 | 作用 |
|---|---|
| 上/下 | 前進或後退 |
| 左/右 | 轉身 |
| A/D | 向左或向右側移 |
| Shift | 按住時奔跑 |
| X | 射擊 |
| 空格 | 開門、扳動開關、乘坐升降台 |
| 1至7 | 武器欄位；按 3 在兩把霰彈槍之間切換 |
| E | 切換到下一件武器 |
| 滑鼠 | 轉身 |
| 點選 | 射擊 |
| 右鍵 | 按住並移動滑鼠來側移；雙擊為開門 |
| 按鍵 | 作用 |
|---|---|
| Tab | 開啟或關閉地圖 |
| -/= | 縮小、放大 |
| 0 | 顯示整個關卡 |
| F | 跟隨模式；關閉時用方向鍵滾動地圖 |
| G | 網格 |
| M | 放置標記 |
| C | 清除所有標記 |
| 按鍵 | 作用 |
|---|---|
| Esc | 主選單 |
| 上/下 | 選中選項 |
| Enter | 選擇 |
| Backspace | 上一級選單 |
| Y/N | 確認或取消 |
MAP15 Hostile Takeover 有一個隱藏出口，通往 MAP31 Be Quiet，而 MAP31 也有自己的隱藏出口，通往 MAP32 Not Sure。從這兩關的普通出口離開會進入 MAP16。
遊戲中輸入 IDDQD 開關無敵模式。IDKFA 給你全部武器、滿彈藥、護甲和全部六把鑰匙；IDFA 效果相同，但不給鑰匙。除了 IDCLEV 和 IDDT，其他作弊碼在 Mayhem! 難度下都無效。
輸入 IDCLIP 可以穿過牆壁和怪物；再輸入一次關閉。
輸入 IDCLEV 加兩位地圖編號，例如 IDCLEV07 進入 MAP07，IDCLEV31 進入第一個隱藏關卡。地圖會作為新遊戲開始。
IDBEHOLD 加一個字母可以獲得強化道具，再輸入同一個密碼會取消：V 為 Vanguard Device，S 為 Strength Symbiote，I 為 Invisibility Cloak，R 為 Rescue Operations Suit，A 為 Area Survey Map，L 為 Low-Light Goggles。IDCHOPPERS 給你鏈鋸，IDMUS 加地圖編號可以換音樂。
開啟地圖時，輸入一次 IDDT 顯示整個關卡，輸入兩次再加上所有怪物和物品，第三次恢復原狀。
